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郭安源/甘璐团队《Nat Immunol》发文揭示一种预测可增强免疫检查点阻断疗效的药物的方法
作者：郭安源 来源自：中国免疫学会 点击数：7523 发布时间：2024-04-01
免疫治疗，特别是免疫检查点阻断（immune checkpoint blockade，ICB）治疗，旨在激活和动员免疫系统清除肿瘤细胞，在多种恶性肿瘤中取得了较好的临床效果。但是，患者响应率较低和单药ICB治疗无效的问题限制了大多数患者临床使用ICB治疗。因此，提高ICB治疗的患者响应率和疗效至关重要。目前与其他药物或疗法联合治疗是提高ICB治疗疗效的有效治疗策略，然而，如何筛选和预测具有增强ICB疗效的药物仍然是较大的挑战。
2024年3月18日，四川大学华西医院郭安源教授团队、华中科技大学甘璐教授团队在《Nature Immunology》杂志发表题为“A method for predicting drugs that can boost the efficacy of immune checkpoint blockade”的研究成果，本研究基于对ICBatlas和ICBcomb数据库中免疫治疗表达数据的挖掘分析，建立了一种名为CM-Drug的免疫检查点阻断治疗联用药物的筛选方法，并开展了实验验证和机制探索。
首先，本研究分析本课题组已经建立的免疫治疗表达数据库ICBatlas和ICBcomb，从中发现与ICB治疗响应和疗效有关的6个特征基因集。我们提出假设：可以基于这些特征基因集筛选潜在的提高ICB响应和疗效的药物。基于此，通过已有小分子药物数据分析建模，建立了一种通用的数据驱动ICB联合药物预测方法，称为CM-Drug。CM-Drug可以在不同肿瘤中预测ICB联用药物，可以成为一种通用预测方法，解决了ICB疗效增强药物的预测和筛选问题。再对药物数据库中的药物开展分析，构建正负数据集，建立LASSO回归模型打分。根据打分筛选ICB联用药物，在黑色素瘤和癌症小鼠模型验证了CM-Drug方法的有效性和准确性。对效果最好的taltirelin进行机制分析和实验，结果表明，其能从T细胞和DC细胞两方面激活CD8+ T细胞，增强抗肿瘤效果。
本研究为预测和评估联合治疗药物提供了一种有效而通用的方法，筛选了大量ICB联合治疗的候选化合物，还可用于筛选其他新的ICB联用药物，甚至天然植物提取物等。这将加快ICB联合治疗的药物开发，促进ICB治疗的研究和临床发展。本研究还发现了下丘脑-垂体轴的激素在免疫治疗中的重要作用。本研究也是生物信息数据库、算法和实验相结合的经典研究模式。
原文链接：https://www.nature.com/articles/s41590-024-01789-x
2024年3月18日，四川大学华西医院郭安源教授团队、华中科技大学甘璐教授团队在《Nature Immunology》杂志发表题为“A method for predicting drugs that can boost the efficacy of immune checkpoint blockade”的研究成果，本研究基于对ICBatlas和ICBcomb数据库中免疫治疗表达数据的挖掘分析，建立了一种名为CM-Drug的免疫检查点阻断治疗联用药物的筛选方法，并开展了实验验证和机制探索。
首先，本研究分析本课题组已经建立的免疫治疗表达数据库ICBatlas和ICBcomb，从中发现与ICB治疗响应和疗效有关的6个特征基因集。我们提出假设：可以基于这些特征基因集筛选潜在的提高ICB响应和疗效的药物。基于此，通过已有小分子药物数据分析建模，建立了一种通用的数据驱动ICB联合药物预测方法，称为CM-Drug。CM-Drug可以在不同肿瘤中预测ICB联用药物，可以成为一种通用预测方法，解决了ICB疗效增强药物的预测和筛选问题。再对药物数据库中的药物开展分析，构建正负数据集，建立LASSO回归模型打分。根据打分筛选ICB联用药物，在黑色素瘤和癌症小鼠模型验证了CM-Drug方法的有效性和准确性。对效果最好的taltirelin进行机制分析和实验，结果表明，其能从T细胞和DC细胞两方面激活CD8+ T细胞，增强抗肿瘤效果。
本研究为预测和评估联合治疗药物提供了一种有效而通用的方法，筛选了大量ICB联合治疗的候选化合物，还可用于筛选其他新的ICB联用药物，甚至天然植物提取物等。这将加快ICB联合治疗的药物开发，促进ICB治疗的研究和临床发展。本研究还发现了下丘脑-垂体轴的激素在免疫治疗中的重要作用。本研究也是生物信息数据库、算法和实验相结合的经典研究模式。
原文链接：https://www.nature.com/articles/s41590-024-01789-x