学术动态
樊嘉/高强/张晓明/杨力团队揭示中性粒细胞的抗肿瘤抗原提呈功能
作者：吴英成 来源自：中国免疫学会 点击数：6419 发布时间：2024-03-21
中性粒细胞是天然免疫的第一道防线，广泛参与肿瘤免疫循环、免疫编辑、免疫逃逸等重要过程。同时，中性粒细胞是人体最丰富的白细胞类型，占人体白细胞的40%至70%，是肿瘤微环境的重要组成部分。但是，中性粒细胞半衰期短（6-8小时）、细胞脆弱，这些困难导致目前鲜有中性粒细胞的大规模系统研究，他们发挥抗肿瘤还是促肿瘤的功能是领域内争议的焦点。近年来在泛癌尺度的肿瘤微环境研究如火如荼，这一策略为系统研究中性粒细胞的功能和表型带来了新的契机。
2024年3月5日，Cell上发表了题为“Neutrophil profiling illuminates anti-tumor antigen-presenting potency”的研究论文，利用自测数据（79.29%）和公共数据（20.71%），基于肝癌、胆管癌、胆囊癌等17个癌种的143例患者共计225例样本的中性粒细胞单细胞转录组，系统性揭示了人源肿瘤相关中性粒细胞的表型多样性和可塑性（如抗原提呈型、促血管新生型、炎症型等），发现HLA-DR+CD74+中性粒细胞在多个癌种和患者预后正相关，可诱导T细胞抗原特异反应并促进形成“热肿瘤”微环境，可作为潜在的免疫治疗增敏策略。
图. 研究设计示意图
在这项研究中，研究者通过整合来自225例患者样本的中性粒细胞单细胞转录组数据，利用聚类分析发现中性粒细胞可分为10大群，如HLA-DR+CD74+抗原提呈型中性粒细胞、VEGFA+SPP1+促血管新生型中性粒细胞、CXCL8+IL1B+炎症型，这些中性粒细胞分别对应着不同的免疫表型、趋化因子特征和成熟状态。在多个癌种中，HLA-DR+CD74+中性粒细胞和更好的预后相关，而VEGFA+SPP1+中性粒细胞和更差预后相关。研究者通过综合利用4种单细胞轨迹算法、多重免疫荧光、流式细胞术等技术，表征了中性粒细胞的不同成熟状态，发现HLA-DR+CD74+中性粒细胞可能处于终末分化的成熟状态，提示了该亚群的重要作用。
因此，研究者进一步聚焦HLA-DR+CD74+中性粒细胞功能和调控机制，通过单细胞代谢通路分析、小规模代谢物体外筛选等，发现亮氨酸代谢和中性粒细胞抗原提呈功能的潜在联系：亮氨酸可上调中性粒细胞的MHC-II类抗原提呈分子HLA-DR及相关共刺激分子表达。作者进一步发现，亮氨酸可通过线粒体结构和功能重塑，并增强乙酰辅酶A生成，上调MHC-II类分子启动子区的H3K27乙酰化修饰，从而上调HLA-DR等抗原提呈分子。为了进一步研究这一群细胞的抗原提呈功能，作者发现HLA-DR+CD74+中性粒细胞可提呈肿瘤新抗原至T细胞，重塑T细胞免疫组库并增强抗原特异反应。这些结果提示了HLA-DR+CD74+中性粒细胞的代谢可塑性及治疗价值。
在此基础上，作者探索了抗原提呈中性粒细胞的抗肿瘤治疗价值。研究者发现多种类型的小鼠肿瘤中也存在CD74+抗原提呈相关的中性粒细胞亚群。在小鼠模型中，富含亮氨酸的饮食或CD74+中性粒细胞过继治疗可增强抗PD-1免疫疗法的疗效。而当抗原提呈中性粒细胞过继处理患者来源性肿瘤组织块（patient-derived tumor fragments，PDTFs）时，T细胞抗原特异反应分子和杀伤分子均显著升高。此外，基于肿瘤患者的免疫治疗测序数据分析发现，抗原提呈中性粒细胞和免疫治疗响应程度显著正相关。
综上，这项工作生成了多癌种的中性粒细胞转录组数据，深入分析了中性粒细胞癌种特异及共享的转录模式、细胞状态、代谢特征、临床相关性，聚焦HLA-DR+CD74+中性粒细胞的抗原提呈功能，探索了利用中性粒细胞抗原提呈来增敏免疫治疗的可能。
复旦大学附属中山医院樊嘉院士和高强教授、中国科学院上海免疫与感染研究所张晓明研究员、复旦大学生物医学研究院杨力研究员为本文通讯作者。复旦大学博士生吴英成、马家强、杨旭鹏、博士后南芳、硕士生张天成为共同第一作者。本研究得到复旦大学雷群英教授、朱棣教授、美国哈佛大学麻省总院朱秀轩教授、法国巴斯德研究所Claude Leclerc教授、上海交大免疫所王峰教授和王静教授的支持。
文章链接：https://doi.org/10.1016/j.cell.2024.02.005
2024年3月5日，Cell上发表了题为“Neutrophil profiling illuminates anti-tumor antigen-presenting potency”的研究论文，利用自测数据（79.29%）和公共数据（20.71%），基于肝癌、胆管癌、胆囊癌等17个癌种的143例患者共计225例样本的中性粒细胞单细胞转录组，系统性揭示了人源肿瘤相关中性粒细胞的表型多样性和可塑性（如抗原提呈型、促血管新生型、炎症型等），发现HLA-DR+CD74+中性粒细胞在多个癌种和患者预后正相关，可诱导T细胞抗原特异反应并促进形成“热肿瘤”微环境，可作为潜在的免疫治疗增敏策略。
图. 研究设计示意图
在这项研究中，研究者通过整合来自225例患者样本的中性粒细胞单细胞转录组数据，利用聚类分析发现中性粒细胞可分为10大群，如HLA-DR+CD74+抗原提呈型中性粒细胞、VEGFA+SPP1+促血管新生型中性粒细胞、CXCL8+IL1B+炎症型，这些中性粒细胞分别对应着不同的免疫表型、趋化因子特征和成熟状态。在多个癌种中，HLA-DR+CD74+中性粒细胞和更好的预后相关，而VEGFA+SPP1+中性粒细胞和更差预后相关。研究者通过综合利用4种单细胞轨迹算法、多重免疫荧光、流式细胞术等技术，表征了中性粒细胞的不同成熟状态，发现HLA-DR+CD74+中性粒细胞可能处于终末分化的成熟状态，提示了该亚群的重要作用。
因此，研究者进一步聚焦HLA-DR+CD74+中性粒细胞功能和调控机制，通过单细胞代谢通路分析、小规模代谢物体外筛选等，发现亮氨酸代谢和中性粒细胞抗原提呈功能的潜在联系：亮氨酸可上调中性粒细胞的MHC-II类抗原提呈分子HLA-DR及相关共刺激分子表达。作者进一步发现，亮氨酸可通过线粒体结构和功能重塑，并增强乙酰辅酶A生成，上调MHC-II类分子启动子区的H3K27乙酰化修饰，从而上调HLA-DR等抗原提呈分子。为了进一步研究这一群细胞的抗原提呈功能，作者发现HLA-DR+CD74+中性粒细胞可提呈肿瘤新抗原至T细胞，重塑T细胞免疫组库并增强抗原特异反应。这些结果提示了HLA-DR+CD74+中性粒细胞的代谢可塑性及治疗价值。
在此基础上，作者探索了抗原提呈中性粒细胞的抗肿瘤治疗价值。研究者发现多种类型的小鼠肿瘤中也存在CD74+抗原提呈相关的中性粒细胞亚群。在小鼠模型中，富含亮氨酸的饮食或CD74+中性粒细胞过继治疗可增强抗PD-1免疫疗法的疗效。而当抗原提呈中性粒细胞过继处理患者来源性肿瘤组织块（patient-derived tumor fragments，PDTFs）时，T细胞抗原特异反应分子和杀伤分子均显著升高。此外，基于肿瘤患者的免疫治疗测序数据分析发现，抗原提呈中性粒细胞和免疫治疗响应程度显著正相关。
综上，这项工作生成了多癌种的中性粒细胞转录组数据，深入分析了中性粒细胞癌种特异及共享的转录模式、细胞状态、代谢特征、临床相关性，聚焦HLA-DR+CD74+中性粒细胞的抗原提呈功能，探索了利用中性粒细胞抗原提呈来增敏免疫治疗的可能。
复旦大学附属中山医院樊嘉院士和高强教授、中国科学院上海免疫与感染研究所张晓明研究员、复旦大学生物医学研究院杨力研究员为本文通讯作者。复旦大学博士生吴英成、马家强、杨旭鹏、博士后南芳、硕士生张天成为共同第一作者。本研究得到复旦大学雷群英教授、朱棣教授、美国哈佛大学麻省总院朱秀轩教授、法国巴斯德研究所Claude Leclerc教授、上海交大免疫所王峰教授和王静教授的支持。
文章链接：https://doi.org/10.1016/j.cell.2024.02.005